La structure du SIG (2)
LA CR É ATION DES DONN É ES TH É MATIQUES
                             Associations végétales et mosaïques
Section  FLORE          Fichier ressource                             Liste sigles                                                 Fichier résultant Section ÉCOLOGIE  et PRODUCTION          Fichier          ressource                                        Liste sigles                                        Fichier résultant Sigle.txt   AFLORE   MXFLORE   XFLORE                       1   2   3   4   5   AECOLO     APRODUCT     MECOLO     MPRODUCT       Sigle.txt   1   2   3 BP Bourgoutière  basse à  Vossia  cuspidata. Ipomoea  aquatica HA 2 3,75% Ipom_  aqu Nelsonia  canescens HA 2 3,75% Nels_ can Nymphaea lotus HA 4 3,75% Nymp_ lot Polygonum  spp. HA 2 3,75% Poly_  spp Echinochloa  stagnina HD 4 40,00% Echi_  sta Vossia  cuspidata HD 4 40,00% Voss_  cus Centrostachys  aquatica HO 2 1,25% Cent_  aqu Meremia  tridentata HO 2 1,25% Mere_  tri Sesbania  rostrata HO 2 1,25% Sesb_  ros Vetiveria  nigritana HO 2 1,25% Veti_  nig Ziziphus  spina-christi LA 3 15,00% Zizi_  spi Mimosa  pigra LD 2 80,00% Mimo_ pig Acacia  kirkii LO 2 5,00% Acac_  kir
Exemple d ' une fiche traitée dans MX FLORE
Fiche MECOLO avec le nom des rubriques de la base de données (voir page 10 «Les variables écologiques»)
Figure 1 : Les moteurs des bases de données
Le   fichier   résultant,   par   l’intermédiaire   de   différents   programmes   (automatiques   ou   manuels),   est   toujours   le   donneur   d’ordres. Ce   système   imaginé   et   réalisé   par   Isabelle   Louise   Bisson,   a   notamment   été   prévu   pour   faciliter   une   remise   à   jour   de   cette   partie   du SIG qui pourrait se faire de plusieurs manières. 1   -   Il   est   possible   de   modifier   le   fichier   source   en   ajoutant   de   nouvelles   fiches   correspondant   à   de   nouvelles   associations   végétales, pourvu    simplement    que    les    sigles    les    désignant    soient    à    chaque    fois    un    code    alphanumérique    comprenant    au    maximum    trois caractères. 2 -  Il est possible, sans ajouter de nouvelles fiches,  de modifier n'importe quelle valeur d'un champ d'une association existante. 3   -   Si   la   couverture   VEG4   venait   à   être   modifiée   lors   d'une   remise   à   jour,   il   est   possible   de   composer   de   nouvelles   mosaïques   par simple modification de la liste sigle.txt listant les mosaïques.
Nous   avons   conservé   pour   la   structure   des   données   thématiques   la   division   en   trois   sections   décrites   dans   l'analyse   des   données   : flore,   écologie,   production .   Les   bases   de   données   sont   montées   dans   un   logiciel   –   l e   SGBDR   File   Maker   –   essentiellement   parce qu'il s'est révélé performant et relativement facile d'emploi. La    difficulté    rencontrée    pour    structurer    les    bases    de    données    vient    du    fait    que    les    formations    végétales     sont    tantôt    des associations   végétales   dont   les   caractéristiques   sont   décrites   dans   des   tables,   tantôt   des   mosaïques   d’associations   végétales .   Dans l'étude   originale,   nous   n'avions   fourni   que   les   caractéristiques   des   associations   végétales.   Il   nous   a   donc   fallu,   en   collaboration   étroite avec   Pierre   Hiernaux,   définir   ce   que   représente   une   mosaïque   et   quel   corpus   de   règles   devait   être   appliqué   pour   composer   les caractéristiques   floristiques,   écologiques   et   de   production   de   ces   mosaïques.   À   l’exception   de   MB,   traitée   séparément   en   raison   de   sa complexité,   les   codes   utilisés   pour   les   mosaïques   sont   formés   des   sigles   juxtaposés   de   deux   formations   végétales   élémentaires   (par exemple   VOR/VH) .   Lorsque   les   deux   formations   végétales   indiquées   sont   écologiquement   apparentées,   qu’elles   appartiennent   au même   niveau   ou   à   des   niveaux   d’inondation   voisins,   cette   notation   est   celle   d’une   mosaïque   binaire   constituée   par   les   deux   formations indiquées.   Par   convention,   l’ordre   dans   lequel   sont   indiquées   les   formations   place   en   premier   la   formation   la   plus   profonde.   Si   les formations   sont   de   même   niveau,   c’est   l’ordre   alphabétique   qui   prévaut.   Pour   les   formations   PAM,   PAN,   PAR,   PAS,   qui   sont inondées   par   ruissellement   et   peuvent   l’être   secondairement   par   la   crue,   la   convention   a   été   adaptée   de   la   manière   suivante.   Si   l’une   de ces   quatre   formations   entre   dans   la   composition   d’une   mosaïque   avec   une   formation   inondée   par   la   crue,   c’est   cette   dernière   qui prévaut.   Ainsi   P   (niveau   3)   combiné   avec   PAN   (niveau   4)   s’écrit   P/PAN   et   non   PAN/P   selon   l’ordre   des   niveaux.   En   revanche   si   les formations   inondées   par   ruissellement   se   combinent   avec   des   formations   sèches   (type   TA,TB,   …)   la   mosaïque   s’écrit   selon   l’ordre   des niveaux   (ex   PAN/TA).   Pour   les   mosaïques   à   fort   gradient,   c’est-à-dire   lorsque   les   deux   formations   indiquées   appartiennent   à   des niveaux   éloignés,   l’indication   n’est   qu’un   raccourci   pour   noter   une   mosaïque   plus   complexe   à   laquelle   participent   non   seulement   les formations   indiquées,   mais   également   d’autres   formations   aux   caractères   écologiques   intermédiaires.   Par   exemple   B/VSP   n’est   qu’un raccourci   pour   indiquer   une   mosaïque   qui   comprend,   outre   B   et   VSP,   les   formations   végétales   EOR,   O,   VOR.   Les   difficultés   ont   été résolues   en   déterminant   les   caractéristiques   de   la   mosaïque   à   partir   de   celles   des   formations   composantes.   Des   règles   de   calcul   ont   été définies   pour   que   cela   puisse   se   faire   systématiquement   et   de   façon   automatique   sur   la   base   des   codes   donnés   aux   formations   et   à   leurs mosaïques.   Le   principe   qui   a   guidé   la   structuration   de   l'information   thématique   consiste   à   séparer   complètement   l'information   initiale concernant   les   28   associations   végétales   de   base   (avec   MB)   de   l'information   résultante   qui   concerne   toutes   les   formations   végétales   associations   et   mosaïques   –   et   qui   découle   de   la   première   par   des   mécanismes   de   calcul   spécifiques.   La   relation   entre   le   fichier   source et   le   fichier   résultant   s'effectue   très   simplement,   via   un   fichier   texte   appelé   sigle.txt ,   une   simple   liste   alphabétique   des   120   sigles correspondant   aux   120   formations   végétales   identifiées   (y   compris   TB/TC,   le   bâti   que   l’on   traite   comme   une   formation   végétale). Lorsqu'on   lance   une   action,   on   ouvre   le   fichier   résultant   (et   on   le   vide   de   toute   information   si   nécessaire)   puis   on   lance   un   " script "   ou programme   de   composition   des   mosaïques.   Le   programme   lit   le   fichier   sigle.txt   contenant   les   sigles.   Pour   chaque   sigle,   il   va   puiser   les ressources   nécessaires   dans   le   fichier   source   et   compose   la   mosaïque   en   calculant   chaque   champ   selon   les   règles   préétablies.   Une association   végétale   est   simplement   une   mosaïque   identique   à   elle-même.   Des   " scripts "   particuliers   permettent   de   composer   des mosaïques à l'unité, en saisissant le sigle "à la main", ce qui est commode pour des tests. Les règles doivent cependant différer en fonction de la nature de l’information traitée : 1   -   Pour   la   composition   floristique   des   mosaïques,   il   a   été   décidé,   quelle   que   soit      la   nature   de   la   mosaïque   (de   type   binaire   ou   de type   complexe),   que   la   flore   de   la   mosaïque   serait   une   simple   "addition"   des   compositions   floristiques   des   associations   composantes,     les   taux   de   participation   à   la   masse   végétale   de   chaque   espèce   étant   recalculé   comme   la   moyenne   de   la   participation   à   chaque composante   de   la   mosaïque.   Le   profil   floristique   présenté   est   donc,   dans   le   cas   d'une   mosaïque   complexe,   un   "raccourci"   ne   prenant   en compte   que   les   associations   végétales   "tenante"   et   "aboutissante".   Cette   simplification   de   l'information   évite,   en   particulier,   des cortèges   floristiques   très   longs   avec   des   participations   très   faibles   pour   chaque   plante   prise   séparément.   De   même,   la   valeur   indicatrice de   la   participation   de   chaque   plante   au   profil   floristique   de   l'association   a   été   abandonnée   dans   la   mosaïque,   cette   indication   n'ayant plus de sens dans ce cas. Par contre le statut de chaque plante - dominante, accompagnatrice, occasionnelle - a été conservé. 2   -   Pour   les   variables   de   production,   qui   sont   toutes   quantitatives,   nous   avons   également   décidé   que   les   valeurs   adoptées   pour   les mosaïques   seraient   de   simples   moyennes   arithmétiques   des   valeurs   des   variables   des   deux   formations   composantes.   Des   essais systématiques,   pour   les   mosaïques   complexes,   ont   été   effectués   avec   des   méthodes   de   calculs   prenant   en   compte   toutes   les   valeurs intermédiaires. Les différences observées sont marginales et ne justifiaient pas l'adoption de telles méthodes. 3    -   Pour   les   variables   écologiques,   nous   avons   en   revanche   décidé   de   tenir   compte   de   la   complexité   réelle   des   mosaïques.   Lorsque les   deux   formations   notées   appartiennent,   soit   au   même   niveau   d’inondation,   soit   à   deux   niveaux   consécutifs,   la   caractérisation   de   la mosaïque   est   obtenue   par   simple   "moyenne"   –   en   fait   une   combinatoire   des   indices   comme   exposé   dans   le   tableau   ci-après   -      des caractérisations   des   deux   formations   composantes.   Par   contre,   lorsque   les   deux   formations   notées   appartiennent   à   des   niveaux différents    et    non    consécutifs,    la    "moyenne"    prend    en    compte    les    niveaux    intermédiaires.    Par    exemple    si    les    deux    formations appartiennent   à   des   niveaux   distants   d’un   niveau,   la   "moyenne"   est   établie   pour   les   caractères   de   chacune   des   deux   formations indiquées   et   aussi   ceux   du   niveau   intermédiaire,   un   poids   égal   étant   donné   à   chaque   composante   qui   participe   donc   pour   un   tiers   à   la mosaïque.   Dans   l’exemple   précédent,   la   mosaïque   B/VSP   doit   se   comprendre   comme   étant   en   réalité   la   mosaïque   B/NIVEAU   5/VSP dans laquelle NIVEAU 5 est une mosaïque résumant EOR/O/VOR. Les   profils   de   probabilité   sont   obtenus   en   suivant   des   règles   empiriques   déjà   utilisées   par   Pierre   Hiernaux   pour   la   détermination des   profils   floristiques   indicés   (ex   :   BP )   à   partir   des   relations   probabilistes   indicées   liant   une   espèce   végétale   (ex   :   Echinochloa stagnina ) et un état de la variable (ex : une classe de hauteur d’eau). La   combinatoire   résulte   de   l’utilisation   de   la   matrice   suivante   dans   laquelle   les   indications   du   tableau   n°   1    sont   remplacées   par   un code numérique : +++   code 4         ++   code 3         +   code 2       •   code 1        0   code 0 Tableau n° 1 : Codage des variables écologiques
Code   Signification statistique   +++   L’  espèce est significativement sensible à l’  état de la variable au seuil de 1 ‰   ++   L’espèce est  significativement sensible à l’état de la variable au seuil de 1 % mais pas de 1 ‰   +   L’espèce est significativement sensible à l’état de la variable au seuil de 5 % mais pas de 1 %      L’espèce n’est pas significativement sensible à l’état de la variable  au seuil de 5 %   0   Echantillon trop faible pour conclure ou absence de données
Tableau n° 2 : : Matrice des combinatoires entre codes indicés des seuils de probabilité
0 1 2 3 4 0 0 0 1 2 3 1 0 1 2 2 3 2 1 2 2 3 3 3 2 2 3 3 4 4 3 3 3 4 4 Codes des seuils de probabilité (formation végétale 1) Codes des  seuils de  probabilité  (formations  végétales 2)
Couverture maîtresse   VEG4   Carte des   formations végétales   Couv. dérivée   FLORE1   TABLE FLORE         Requêtes sur la  Flore   Couv. dérivée   CRUE3   TABLE ECOLOGIE         Requêtes sur    L’  écologie   Modèle discret   Des surfaces  inondables   Couv. dérivée   SOL1 & SOL2   Couv. dérivée   VEG 7   Cartes de la répartition  spatiale de certaines  espèces végétales   Cartes des sols   Opérateurs  spatiaux   Transformation  en matrice   Morphologie  mathématique   Modèle en  isolignes d’ égale  profondeur de  submersion     1 -   calcul des surfaces  inondables pour toutes les hauteurs de crue.   2  -   Détermination des cuvettes  principales   3  –   Seuillage de la carte des  formations végétales   4 –   Utilisation du modèle pour  la détermination de l’  espace des  crues utiles pour la riziculture   5 -   Calcul d'un M.N.T Du delta  Intérieur   .........   …..   Calcul des surfaces  inondées pour  différentes hauteurs  de crue
Figure 2 : L’architecture du SIG pour la partie VÉGÉTATION